Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PALD1Q9ULE6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PALD1Q9ULE6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PALD1Q9ULE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PALD1Q9ULE6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 949.5 ms