Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF3C4Q9UKN8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF3C4Q9UKN8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GTF3C4Q9UKN8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF3C4Q9UKN8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms