Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms