Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DKK3Q9UBP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DKK3Q9UBP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DKK3Q9UBP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DKK3Q9UBP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms