Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNTN3Q9P232 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTN3Q9P232 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN3Q9P232 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms