Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EMC3Q9P0I2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMC3Q9P0I2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMC3Q9P0I2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC3Q9P0I2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms