Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms