Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
ARHGAP35Q9NRY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
ARHGAP35Q9NRY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ARHGAP35Q9NRY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.03
ARHGAP35Q9NRY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
ARHGAP35Q9NRY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4
ARHGAP35Q9NRY4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
ARHGAP35Q9NRY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
ARHGAP35Q9NRY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
ARHGAP35Q9NRY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms