Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3GLB2Q9NR46 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SH3GLB2Q9NR46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3GLB2Q9NR46 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SH3GLB2Q9NR46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms