Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP4F12Q9HCS2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F12Q9HCS2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F12Q9HCS2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F12Q9HCS2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms