Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPNS1Q9H2V7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPNS1Q9H2V7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPNS1Q9H2V7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPNS1Q9H2V7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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