Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms