Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MESP1Q9BRJ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MESP1Q9BRJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MESP1Q9BRJ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms