Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2D3AQ9BRG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2D3AQ9BRG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SH2D3AQ9BRG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH2D3AQ9BRG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms