Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USB1Q9BQ65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USB1Q9BQ65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USB1Q9BQ65 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USB1Q9BQ65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms