Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCLRE1CQ96SD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCLRE1CQ96SD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1CQ96SD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms