Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSGA13Q96PP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSGA13Q96PP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSGA13Q96PP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSGA13Q96PP4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms