Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1MQ96MI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1MQ96MI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1MQ96MI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.2 ms