Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC42Q96M95 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC42Q96M95 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC42Q96M95 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC42Q96M95 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC42Q96M95 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms