Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCDC42Q96M95 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC42Q96M95 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC42Q96M95 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC42Q96M95 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC42Q96M95 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC42Q96M95 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CCDC42Q96M95 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CCDC42Q96M95 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC42Q96M95 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCDC42Q96M95 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC42Q96M95 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC42Q96M95 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC42Q96M95 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC42Q96M95 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC42Q96M95 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC42Q96M95 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC42Q96M95 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC42Q96M95 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC42Q96M95 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC42Q96M95 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC42Q96M95 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC42Q96M95 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC42Q96M95 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC42Q96M95 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC42Q96M95 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC42Q96M95 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC42Q96M95 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC42Q96M95 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC42Q96M95 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC42Q96M95 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC42Q96M95 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC42Q96M95 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC42Q96M95 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC42Q96M95 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC42Q96M95 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC42Q96M95 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC42Q96M95 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC42Q96M95 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC42Q96M95 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC42Q96M95 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCDC42Q96M95 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC42Q96M95 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC42Q96M95 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC42Q96M95 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC42Q96M95 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC42Q96M95 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC42Q96M95 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC42Q96M95 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC42Q96M95 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC42Q96M95 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC42Q96M95 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC42Q96M95 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC42Q96M95 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC42Q96M95 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC42Q96M95 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC42Q96M95 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC42Q96M95 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC42Q96M95 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC42Q96M95 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC42Q96M95 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC42Q96M95 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC42Q96M95 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC42Q96M95 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC42Q96M95 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC42Q96M95 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC42Q96M95 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC42Q96M95 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC42Q96M95 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC42Q96M95 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC42Q96M95 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC42Q96M95 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC42Q96M95 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC42Q96M95 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CCDC42Q96M95 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC42Q96M95 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC42Q96M95 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC42Q96M95 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC42Q96M95 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC42Q96M95 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC42Q96M95 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC42Q96M95 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC42Q96M95 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC42Q96M95 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC42Q96M95 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC42Q96M95 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC42Q96M95 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC42Q96M95 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC42Q96M95 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC42Q96M95 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC42Q96M95 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC42Q96M95 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC42Q96M95 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC42Q96M95 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC42Q96M95 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC42Q96M95 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC42Q96M95 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC42Q96M95 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC42Q96M95 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC42Q96M95 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms