Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMX3Q96JJ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TMX3Q96JJ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMX3Q96JJ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMX3Q96JJ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMX3Q96JJ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMX3Q96JJ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms