Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIG1Q96JA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRIG1Q96JA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIG1Q96JA1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms