Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF6Q96J87 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF6Q96J87 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CELF6Q96J87 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CELF6Q96J87 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CELF6Q96J87 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF6Q96J87 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CELF6Q96J87 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF6Q96J87 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF6Q96J87 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CELF6Q96J87 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms