Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM41AQ96HV5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM41AQ96HV5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms