Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LHX4Q969G2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LHX4Q969G2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LHX4Q969G2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms