Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG4AQ8WYN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG4AQ8WYN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4AQ8WYN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms