Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEW8

PARD3B, Partitioning defective 3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD3BQ8TEW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARD3BQ8TEW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARD3BQ8TEW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARD3BQ8TEW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARD3BQ8TEW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms