Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN3Q8TDD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN3Q8TDD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCOLN3Q8TDD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN3Q8TDD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms