Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
IGSF1Q8N6C5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
IGSF1Q8N6C5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IGSF1Q8N6C5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
IGSF1Q8N6C5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
IGSF1Q8N6C5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
IGSF1Q8N6C5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
IGSF1Q8N6C5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
IGSF1Q8N6C5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IGSF1Q8N6C5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
IGSF1Q8N6C5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IGSF1Q8N6C5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms