Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MSL3Q8N5Y2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MSL3Q8N5Y2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MSL3Q8N5Y2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms