Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDDC3Q8N4P3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDDC3Q8N4P3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDDC3Q8N4P3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDDC3Q8N4P3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDDC3Q8N4P3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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