Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARHGEF28Q8N1W1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARHGEF28Q8N1W1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARHGEF28Q8N1W1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARHGEF28Q8N1W1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ARHGEF28Q8N1W1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARHGEF28Q8N1W1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
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