Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ4

GPALPP1, GPALPP motifs-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPALPP1Q8IXQ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPALPP1Q8IXQ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPALPP1Q8IXQ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPALPP1Q8IXQ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPALPP1Q8IXQ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms