Protein–RNA interactions for Protein: Q86XN7

PROSER1, Proline and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER1Q86XN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROSER1Q86XN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROSER1Q86XN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PROSER1Q86XN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROSER1Q86XN7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROSER1Q86XN7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROSER1Q86XN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms