Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG6

NEK8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK8Q86SG6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEK8Q86SG6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NEK8Q86SG6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEK8Q86SG6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEK8Q86SG6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEK8Q86SG6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
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