Protein–RNA interactions for Protein: Q6WKZ4

RAB11FIP1, Rab11 family-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1Q6WKZ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP1Q6WKZ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB11FIP1Q6WKZ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP1Q6WKZ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP1Q6WKZ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms