Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXF1

TMEM108, Transmembrane protein 108, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM108Q6UXF1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM108Q6UXF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM108Q6UXF1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM108Q6UXF1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM108Q6UXF1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM108Q6UXF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms