Protein–RNA interactions for Protein: Q6PML9

SLC30A9, Zinc transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A9Q6PML9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A9Q6PML9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC30A9Q6PML9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms