Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SWSAP1Q6NVH7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SWSAP1Q6NVH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWSAP1Q6NVH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SWSAP1Q6NVH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SWSAP1Q6NVH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms