Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
RPGRIP1LQ68CZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RPGRIP1LQ68CZ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RPGRIP1LQ68CZ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RPGRIP1LQ68CZ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms