Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LCN1P1Q5VSP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCN1P1Q5VSP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCN1P1Q5VSP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms