Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGO2Q562F6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGO2Q562F6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGO2Q562F6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SGO2Q562F6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGO2Q562F6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms