Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC27Q2M243 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC27Q2M243 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC27Q2M243 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC27Q2M243 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCDC27Q2M243 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC27Q2M243 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms