Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SWI5Q1ZZU3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SWI5Q1ZZU3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SWI5Q1ZZU3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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