Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GEN1Q17RS7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
GEN1Q17RS7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GEN1Q17RS7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GEN1Q17RS7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GEN1Q17RS7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GEN1Q17RS7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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