Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF1Q15637 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF1Q15637 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF1Q15637 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF1Q15637 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF1Q15637 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF1Q15637 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF1Q15637 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF1Q15637 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF1Q15637 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF1Q15637 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF1Q15637 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF1Q15637 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF1Q15637 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF1Q15637 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF1Q15637 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF1Q15637 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF1Q15637 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF1Q15637 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF1Q15637 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF1Q15637 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF1Q15637 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF1Q15637 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF1Q15637 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF1Q15637 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF1Q15637 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF1Q15637 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF1Q15637 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF1Q15637 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF1Q15637 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF1Q15637 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF1Q15637 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF1Q15637 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF1Q15637 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF1Q15637 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SF1Q15637 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SF1Q15637 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF1Q15637 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF1Q15637 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF1Q15637 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF1Q15637 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF1Q15637 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF1Q15637 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF1Q15637 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF1Q15637 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF1Q15637 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF1Q15637 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF1Q15637 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF1Q15637 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SF1Q15637 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF1Q15637 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF1Q15637 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF1Q15637 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF1Q15637 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF1Q15637 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF1Q15637 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF1Q15637 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF1Q15637 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF1Q15637 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF1Q15637 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF1Q15637 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF1Q15637 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF1Q15637 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF1Q15637 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF1Q15637 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF1Q15637 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF1Q15637 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SF1Q15637 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF1Q15637 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF1Q15637 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF1Q15637 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF1Q15637 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF1Q15637 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF1Q15637 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF1Q15637 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF1Q15637 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF1Q15637 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF1Q15637 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF1Q15637 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF1Q15637 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF1Q15637 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SF1Q15637 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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