Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TAF1AQ15573 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TAF1AQ15573 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1AQ15573 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1AQ15573 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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