Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIX1Q15475 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIX1Q15475 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX1Q15475 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX1Q15475 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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