Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB3BPQ13352 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB3BPQ13352 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB3BPQ13352 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB3BPQ13352 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB3BPQ13352 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
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