Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.654e-11■■■■■ 42.6
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TARDBPQ13148 CHEK1-205ENST00000498122 755 ntTSL 28.66□□□□□ -1.021e-11■■■■■ 42.6
TARDBPQ13148 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 42.6
TARDBPQ13148 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 42.6
TARDBPQ13148 NEK7-206ENST00000493790 1021 ntTSL 26.99□□□□□ -1.297e-13■■■■■ 42.5
TARDBPQ13148 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-204ENST00000392645 2842 ntTSL 213.59□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)11.25□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 42.4
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TARDBPQ13148 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 511.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-207ENST00000482447 1711 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-204ENST00000395117 1745 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 42.4
TARDBPQ13148 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.054e-11■■■■■ 42.3
TARDBPQ13148 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.284e-35■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 ANKLE2-205ENST00000538591 886 ntTSL 39.13□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 37.69□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 56.51□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 TNFRSF8-204ENST00000479933 2120 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.53e-13■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-13■■■■■ 42.2
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TARDBPQ13148 TNFRSF8-205ENST00000514649 2412 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.373e-13■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 CTSB-223ENST00000532370 693 ntTSL 217.27■□□□□ 0.363e-13■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 CTSB-209ENST00000525315 586 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-13■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-13■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-13■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 29.95□□□□□ -0.823e-13■■■■■ 42.2
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TARDBPQ13148 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 412.25□□□□□ -0.458e-17■■■■■ 42.2
TARDBPQ13148 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 410.94□□□□□ -0.668e-17■■■■■ 42.2
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TARDBPQ13148 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 58.87□□□□□ -0.998e-17■■■■■ 42.2
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TARDBPQ13148 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 523.03■■□□□ 1.281e-12■■■■■ 41.8
TARDBPQ13148 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 516.53■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 41.8
TARDBPQ13148 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.221e-12■■■■■ 41.8
TARDBPQ13148 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-12■■■■■ 41.8
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TARDBPQ13148 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-12■■■■■ 41.8
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TARDBPQ13148 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 41.7
TARDBPQ13148 GLB1-205ENST00000436768 558 ntTSL 323.03■■□□□ 1.284e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.364e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-219ENST00000498537 570 ntTSL 415.54■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 41.6
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TARDBPQ13148 GLB1-204ENST00000415454 591 ntTSL 410.22□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-207ENST00000440656 626 ntTSL 48.81□□□□□ -14e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-215ENST00000482097 547 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-216ENST00000485698 550 ntTSL 48.8□□□□□ -14e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 GLB1-206ENST00000438227 569 ntTSL 46.78□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 VDAC1-204ENST00000425992 703 ntTSL 323.76■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 41.6
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TARDBPQ13148 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 VDAC1-205ENST00000466080 831 ntTSL 36.32□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 327.77■■■□□ 2.041e-21■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.611e-21■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.281e-21■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 ESRRA-205ENST00000468670 742 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-21■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.651e-21■■■■■ 41.6
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